try-catchで捕捉したら、throwしてあげれば闇へ葬り去ることができる。
┌──────────────────────────────────────┐
│try {                                                                       │
│    処理                                                                    │
│} catch (e) {                                                               │
│    if (e.name == 'ReferenceError') {                                       │
│        throw e;  // エラーを握り潰す                                       │
│    }                                                                       │
│}                                                                           │
└──────────────────────────────────────┘
ま、握り潰す対象は、エラー名称とかで絞り込んだ方がいいけどね(上記は一例)。

これによって、IEの左下に警告△アイコンが出なくなるよん。