┌──────────────────────────────────────┐
│Dim yMax As Long, y As Long                                                 │
│With ActiveSheet                                                            │
│    yMax = .UsedRange.Rows(.UsedRange.Rows.Count).Row                       │
│    MsgBox yMax                                                             │
│    For y = 2 To yMax                                                       │
│        MsgBox .Cells(y, 1).Value                                           │
│    Next y                                                                  │
│End With                                                                    │
└──────────────────────────────────────┘
  上記のようなシートを走査する処理にて、
  実際のシート(の行)が非表示でも影響は受けない。

  フィルタリングによる非表示も、非表示化による非表示も同じ(影響なし)。