チェックアウトしたものの環境が異なるため(*1)正しく読み込めない場合がある
*1：LinuxファイルをWindows環境に持ってきた場合など

この場合、以下の方法がある

・差分がないのに常時差分があると認識してしまう場合
  →除外する…①

・チェックアウト自体できない(クリーンアップもできない)
  →一旦やり直して(全削除して)、該当するものをチェックアウトしない…②

①除外する方法
  SVNメニューより「特定のリビジョンへ更新」を選択
  「更新の深さ」を「除外」にして「OK」ボタンを押下
  後は、(「SVNコミット」ではなく)「クリーンアップ」を実行する

②チェックアウトしない方法
  「SVNチェックアウト」実行時に、「チェックアウトする項目の深さ」で
  「項目を選択」ボタンを押下する
  すると、ツリー表示されるので、チェックアウトするものにチェックを入れて
  (チェックアウトしないもののチェックをはずして)「OK」ボタンを押下する
  (すると「再帰的」から「個別に深さを指定」(*1)に変わる)
  *1：プルダウンメニュー上の選択肢にはない
      「項目を選択」ボタンを押下で初めて表示される項目
  後は、「OK」ボタン押下でチェックアウトする